Skriveno listovo selo nalazi se unutar zemlje vatre, jedno od pet velikih šinobih nacija. Boruto Uzumaki živi ovdje i on je sin seoskog vođe, Naruto Uzumaki, sedmo hokage. Jednog dana Boruto štedi dječaka po imenu Denki Kaminarimon, koji je pokupiti. Denki je fizički slab, pa nije u stanju da se suprotstavi nasilnicima. Na putu za ceremoniju ulaza na Nindžini akademiju, Boruto ponovo vidi Denkija. Primjećuje da je njegova čakra iskrivljena i da se ponaša čudno.

Nakon što su suspendovani zbog uzbuđenja izazvao na ulaznoj ceremoniji, Boruto prvi put prolazi do Akademije. Njegovi razrednici ostruširaju ga za sin sedmog hokaža i za suspendovanje. Iwabe Yuino, jedan od Borutovih razreda, bira s njim borba. Iwabe je stariji student koji ima oštro smisao za bitku, ali je održan godinu dana zbog svog lošeg ponašanja. U početku, Boruto ga ignoriše bez obzira na ono što kaže. Ali kad vidi Iwabe Punch Denki zbog toga što mu kažem da se zaustavi, Boruto ga više ne može ignorirati.

Bortoov razrednik, metalni lee, vrlo je diligentan i vješt je u Taijutsu. Nažalost, on se lako nervira i ne može dati sve od sebe kada ga ljudi gledaju. Jednog dana jedan od njegovih razreda, Shikadai Nara, kaže nešto što odiše metal, koji napada Shikadai sljedećeg dana. Uhvaćen u sredini, Boruto primjećuje da je metalska čakra iskrivljena, baš kao i Denki.

Na prijedlogu Shino Aburame, njihov domaći učitelj, Boruto i njegovi razrednici podijelili su se u rodne timove za snimanje zastava postavljenih na krovu. Boruto i ostatak dječačkog tima brzo se kreću za krov, ali se bore sa zamkama i djevojčicama, na čelu sa Saradom Uchiha i Chocho Akimichi. Očajnički za snimanje zastave prije momčadi za djevojčice, Boruto pokušava pozvati Jutsu, ali on završava pozvati nešto neočekivano!

Novi student po imenu Mitsuki iz skrivenog zvuka pridružuje se Borutovoj klasi. Student po imenu Mitsuki prešao je u Boruto klasu iz skrivenog zvučnog sela. On preplavi Iwabe u sparingu i pokazuje svoj genij rješavanje teških problema. Međutim, Boruto i ostali nisu u mogućnosti reći šta misli. U međuvremenu, neko ko radi popravku rada na školi, iznenada ide Berserk. Boruto i ostali žuri. Pojavljuje se druga strana Mitsukija kako započinje mrmljajući čudne riječi.

Boruto, Shikadai i Mitsuki stižu na lokaciju, rečeno im je da odlaze s Shino. Primjećuju da njihov učitelj djeluje drugačije nego što obično radi - i Shino iznenada napada! Shino pripada klanu Aburame, klanu korisnika insekata. Otkriva roj parazitskih insekata. Boruto i ostali ne mogu odgovarati vještini nekoga ko je Jonin. Ali čak i u ovoj situaciji, Mitsuki ostaje miran i hladno zuri u Shino.

Cho-Cho se uplaši jer ona misli da ga neko gleda, pa odluči da ih uhvati u činu. Uspijeva ubijajući Magire Kakuremino, a ispostavilo se da ne gleda Cho-Cho, već Sumire, klase, koga potajno voli. Cho-Cho nagovara ga da proglasi svoju ljubav i u prvom magire oklijevanju. Ali on uzima skok i govori Sumire kako se osjeća!

Shawyy, iskrivljena čakra da samo Boruto može vidjeti preuzima više ljudi, uzrokujući da ih dižu. Isprva su samo utjecali na ljude unutar Akademije, ali sada se proširuje dosega u selo. Može li se zaustaviti? A kasnije, vizualni Jutsu postavlja Boruto u snu - i nakon toga, Boruto izjavljuje da je san probudio svoj Byakugan, Kekkei Genkai jedinstven za Hyuga Clan. Naruto mu ne vjeruje, pa Boruto traži savjet svog djeda, Hiashi Hyuga.