Lisa Mishima ima problema u školi i kod kuće kada su dva misteriozna dječaka prebacila u svoju školu, a ona je uhvaćena u terorističkom napadu.

Dok policija naporno radi za analizu Sfingovog prvog napada, Sfinx prenosi novi video. Hoće li oni rešiti novu zagonetku na vrijeme?

Shibazaki se pridružuje timu radeći na slučaju Sfinx dok Sfinx pokušava potvrditi svoje sumnje sa svojom sljedećom zagonetkom.

Kao odgovor na raniju provokaciju, Shibazaki se ovaj put osporava zagonetka samo što može riješiti kako bi zaustavio bombu od eksplozije, ali u jednom stanju, niko ne može varati.

Kako Lisa oporavlja na devet i dvanaest mesta, sfinge postavlja drugu bombu i objavljuje drugu zagonetku, ali stvari ne idu kako ovaj put ne ideju onako kako je ovo vrijeme.

Pet preuzima bitku od matice protiv devet i dvanaest, jer Lisa pokušava pronaći svoje mjesto u svojoj grupi, ali Shibazaki nije sretan što se ne sjedi idly.

Igra je na aerodromu i životi su u pitanju kao Shibazaki i njegov tim se uzivaju u sredinu od devet i petogodišnje opasne igre šaha.

Nakon incidenta na aerodromu, devet i dvanaest prisiljeni su da napuste svoje skrovište, a Shibazaki je suspendovan, ali nastavlja tražiti istinu.

Dvanaest odlazi da spasi Lisu dok Shibazaki i Hamura saznaju više o planu Atine i mirovne akademije.

Stvari dolaze na glavu kao devet i dvanaest idu svojim zasebnim načinima i Shibazaki razgovaraju sa Mamijom, čovjeku iza plana Atine.

Tokio je u vanrednom stanju, jer zemlja čita samo za eksploziju atomske bombe. Hoće li se misterija sfinga konačno riješiti?