Kad Jaden dođe kasno na svoj prijemni ispit za dvobojnu akademiju, mora da pređe iznad i izvan očekivanja da bi dokazao da zaslužuje da napravi rez!

Dolazna klasa je dočekana za dvoboj Akademiju, ali Jaden nalazi manje od toplog prijema od Freshman Hot Shot Chazz kada je izazvan u dvoboj visokih uloga!

Kad se Sirus umrli u djevojčice, on se stavlja i Jadena u opasnost da se izbacuju prisiljavajući Jadena da osvoji dvoboj da bi osvojio svoju slobodu.

To je duel monsters duhovni dan na Akademiji, ali kada neko ko izgleda izvanredno poput darke magičarske djevojke, za godišnji kostim Duel Syrus ide Gaga.

Kad Jaden i posada lutaju napuštenom spavaonicom, nailaze na misteriozni duel koji tvrdi da je uzeo Aleksis u sjenu carstva, a osim ako ga Jaden duši, on će ga održati tamo.

Jaden nastavlja svoj dvoboj sa misterioznim duelistom sjene, koji se sada bori, a ne samo za Aleksisovu dušu, već i sama!

Uhvaćen za prekršaj u napušteno spavaonica Jadena i Sirus osuđeni su na dvoboj ekipe Tag gdje se ako izgube, oni se izbacuju, pa da se pripremi za veliki meč.

Da bi pomogao Syrusu prevladati neke ozbiljne probleme sa povjerenjem, Jaden izgled u Duel Zane, Syrusov stariji brat i najbolji duel u Duel Academy!