U Japanskim ratnim stanjima, lord Daigo Kagemitsu čini pakt sa 12 demona, nudeći im svog nerođenog sina u zamjenu za prosperitet svojih zemljišta. Godinama kasnije, mladi lopov Dororo napada je groul, ali spasio misteriozni dječak, čiji se dijelovi tijela pokazuju da su gotovo u potpunosti protetički.

Dororo i Hyakkimaru događaju se na selu i dovode se prije njenog šefa, Lady Bandai. Međutim, Hipakkimaru neobjašnjivo izvlači svoj mač u njenom prisustvu, što je rezultiralo da ga i Dororo budu zaključani u skladištu iz mještana. Ispada da nisu jedini tamo zatvoreni ...

Jukai je ljekar koji putuje zemljištem koji odgovara protetskim rukama i nogama onima koji su izgubili udove u ratu. Jednog dana, na obali rijeke nalazi se beba koja nedostaje većina svojih dijelova tijela. On odlučuje da odgaja dijete, ko imenima "Hyakkimaru". Jukai pruža djetetu sa protezama, ali vrijeme dolazi kada se Hyakkimaru izlazi na putovanje da povrati vlastite dijelove tijela.

Dororo Onikimaru se suoče sa tanosuke, muško klanje. Mač koji je imao je bio prokleti dekorija u kojem Đavo živi. Iako jedva odbacivanje Tanosuke, vojni mač prelazio je na ruke ruku, a konjani su manipulirani oružjem.

Bori se da se prilagodi nepoznatom svijetu "zvuka", Hyakkimaru je povrijeđen u svađi s jelom. Uzeo ga je i njegovana djevojka po imenu Mio, koja brine o djeci siroče od rata. Međutim, nakon što je postao svjestan demona u blizini, Hyakkimaru se kreće da se bori prije nego što se u potpunosti oporavio.

Hyakkimaru je povratio glas iz vraga Boga, ali jedna je noga ukradena od njega. Nakon povratka u napušteni hram i da su se rane pobrinule, ponovo se ulazi u bitku sa demonom. U međuvremenu, u napuštenom hramu u kojem su mio i djeca čekaju ...

Spider-poput Ghoula Jorogumo ranjeni od strane Hyakkimaru. Da se izliječi, on se transformiše u ženu i iskorištava gostoprimstvo mladića po imenu Yajiro. Dopuštavši da Jorogumo prolazi kroz prste, Dororo i Hyakkimaru zaustavljaju se u selu u kojem čuju glasine otmičare.

Na određenom selu mlade djevojke se nude kao obrevne žrtve da bi se mole džinovsko stoent demona koji se pojavljuje obložen crnim oblacima. Hyakkimaru i Dororo tim gore sa Saru, dječaka čija je starija sestra ponuđena kao žrtva, a zajedno suočavaju se sa demonom.

Dororo se spušta s visokom groznicom. Dok je Woozy iz njegovih učinaka, mladić upada pogled na neke crvene paukove ljiljane, što uzbuđuje uspomene u proteklih dana provedenih sa roditeljima Hibukuro i Ojiya.

Selo unutar Daigove domene terorizira je gromobran koji živi u obližnjem jezeru. Tahomaru, u pratnji njegovih pomoćnika Hyogo i Mutsu, volonteri da istrebiju jehol.

Nakon ulaska u domenu Lord Daigoa, Dororo i Hyakkimaru čuju priče o banmonu, ogroman zid koji je posljednji ostatak utvrde koji je nekada stajao na granici. Hyakkimaru kvadrati su od nas demona lisice koji proganja zid.

Kagemitsu, koji je ponudio vlastiti sin demonima. Hyakkimaru, koji pokušava vratiti dijelove tijela koji su odvedeni od njega. Kao da se nacrtaju zajedno sa sudbinom, suočavaju se međusobno.