Narumi Katou, u medvjeđe kostimu promovirajući cirkus slame, susreće se sa Masaru Saiga, koji slučajno pokreće Narumijski napad Zonapha. Masaru-ov smijeh štedi Narumi, ali on je oteo muškarci u crnim odijelima. Narumi ga spašava, bježeći vlakom. Masaru dijeli smrt svog oca i nasljedstvo vezano za marionete Karakuri. U vozu su napadnuli lutke, otkrivene kada se neko uništi. Masaru poziva Shirogane, harlekin-oklopna žena, koja lutkarke harlekin koristi iz kofera kako bi pobijedio napadača. Shirogane uzima Narumi i nesvjestan Masaru na kliniku, dok progonitelj implementira lutka pulcinelu.

Ashihana šalje pulcinelu da napadne, ali Shirogane Harlequin lako ga pobedi. Gang Ashihana bilježi Masaru, ali Narumi ga spašava, patnju na napad Zonapha. Ne može se smijati shirogane ili masaru, Narumi dobiva Shirogane da ga pobije u prodavnici, izliječivši svoj napad. Shirogane i Masaru se useljavaju u Narumijev stan, nesvjesni su ih gledaju. Lutka Grimaldi ugrađuje Masaru kroz prozor. Ashihana, iz tima za klanje otkriva da je Kinap tim uzeo Masaru u saiga vilu u Karuizawa, ispunjena opasnim lutkama Karakuri i nudi ih da ih tamo vodi.

Masaruov ujak, Zenji Saiga, tvrdi da ga zaštiti, ali podiže sumnje. Narumi i Shirogane oluja Saiga vila, sukobljava se sa kidnapskom timom dok slijedi tim za klanje. Shiroganeov harlekin uništava vrata zamke i lutku teogualtier. Masaru otkriva očeve bilješke otkrivajući da je mamac da uništi Klanu Kuroga. Narumi i Shirogane spadaju u zamku, pokrećući Narumijski zonapha napad. Shirogane dijeli svoju prošlost kao master marioneta i zašto se ne može smijati. Masaru bježi iz zenji skakanjem iz prozora, slijetanje sigurno blizu Ashihana, koga pokušava zaposliti.

Ashihana opada Masaru ponuda dok dnevnik ne otkriva eksploataciju tima klanja Saiga. Korištenje Grimaldi, Ashihana ponovno ulazi u vilu. Yamanaka zamrače Narumi i Shirogane, a Masaru se slaže da će biti Zenjin sin, ali napada ga kad Zenji planira da ih ubije. Shirogane dijeli svoje tragično djetinjstvo s Narumijem. Masaru i Ashihana koriste Grimaldi da ih oslobode, ali Yamanaka ponovo napadi. Masaru kontrolira Harlequin, premještajući bitku dok eksploziv ne uništavaju vilu. Masaru, Narumi i Shirogane preživljavaju, ali ostaje samo Narumijeva lijeva ruka.

Dva mjeseca kasnije Masaru se oporavlja i živi sa Shiroganeom, koji upisuje u obližnju srednju školu kako bi ga zaštitila od nasilnika. Masaru slegne ramenima sa zmijama, pokazujući svoje ožiljke. Shinobu Nakamachi se suočava s iseljenjem prilikom obnavljanja cirkusa. U školi Masaru dobiva prihvaćanje, a akrobatski talenti Shirogane čine je popularnim. Masaru uzima Shirogane da se upozna nakamachiju, uvjeravajući je da se pridruži svom cirkusu sa Nori, HIRO-om i životinjskim rukovodiocem Liselotte. U međuvremenu, Narumi leži nesvjesno u intenzivnoj njezi, nedostaje mu lijeva ruka.

Narumi se probudi u Ilinois bolnici sa amnezijom i protetskom rukom, sačuvali momka Christophe Resh. Bolnica, vodi dr. Banhart, nalazi se 2.000 djece sa Zonapha sindromom, gdje se osoblje nasmiješi da spreči napade. Narumi saznaje da se terminal zonapha pacijenti za zadržavaju između života i smrti. Ressh otkriva da će ponoćni cirkus koristi automata za širenje Zonapha i pita Narumi da postane shirogane. Posljednja Aqua Vitae zacijelila je Narumi. Kad Paulmann i Anselmus napadaju školu, Resh koristi svoju Karakuriju Olimpiju, a Narumi pomaže pobijediti ih.

Paulmann i Anselmus povrede Narumi, ali njegov zacjeljivanje Aqua Vitae-a koji poboljšavaju mu da ih uništi. Narumi se slaže da postane shirogane za zaštitu djece. U Cirkusu Nakamachi, Shirogane nastupa kao klovn i izaziva se Vilma. Te noći Vilma Corners Masaru da ga ubije, ali zaustavlja ga Shirogane, koji se oporavlja od vilmenih noževa i pobedi je sa Harlekinom. Impresioniran je lojalnošću Shiroganea i Masaruovo rješavanje, Vilma se pridružuje Nakamachi Cirkusu.

Shirogane ulazi u kozmetički konkurs za publicitet Nakamachi Circus. Masaru uvjerava Lise da nastupi, dok Shirogane podsjeća na narumi. U Kini, Narumi, momku i Lucille suočavaju se sa deset otmičnih automata u njihovom ravnini. Narumi ih pobijedi bez pokretanja eksplozija. Napad insetekta gospodina Spazze i momak izlazi u borbu protiv njih dok Lucille sleti avion u zaljevu. Otvor Nakamachi Circus poremećen je sudarom. Shirogane zaustavlja Automaton Magdalen iz napada Masaru, a Narumi se pojavljuje kroz plamen.

Nakon sudara, Shirogane spašava momak i dijeli njenu prošlost s njim i Narumi. Masaru, proganjani snovima, pretražuje Narumi. U kineskim planinama, Narumi, Lucille i Ming-Xia pronađite oca Ming-Xia, Liang Jian-Feng, sa Zonapha na akvalnoj oprugu Aqua Vitae. Prepričava svoje pretke, yin i jin, koji su studirali alkemiju u Pragu. Narumi prepoznaje priču, prisjećajući se ljubavi braće za Francine, što je uzrokovalo njihov razbuk.

Narumi prepričava Yin-ove uspomene: Jin je oteo Francine nakon što je odabrala yin. Godinama kasnije, yin je pronašao Francine zatvorenu u Quiberonu, umirući od bolesti. Usavršio je Aqua Vitae da je spasi, ali ona je umrla u požaru. Jin je kasnije stvorio automatsku, damu francine, animirao Aqua Vitae i proširila Zonapha da bi prisilila seljane da je nasmiju. Lucille, preživjeli, stekao je Yin's uspomene i Harlekin, vijući da uništavaju Jinove automate. Pantalone traži aqua vitae, ali Liang Jian-Feng pokreće eksploziju, uništavajući proljeće.

U Maineu, Shirogane-OS se priprema za napad u ponoćni cirkus u Sahari. Narumi, Lucille i Ming-Xia Pridružite im se, upoznavanje Georgea Larohe i Ashihana u Francuskoj. Na cirkusu se suočavaju sa beskrajnim zapovjednikom i njegovom shiroganom-OS-om. Les Quatre Pionniers predlažu jedne na jednoj bitku. ZED uništava dva automata, ali je poražen od veselog kruga Olsen. Narumi razbija automat, dok Fatima i Ming-Xia se suočavaju sa oraziom i pedrolinom. Nakon pobjede, zamka ih šalje na drugi izazov.

Fatima i Ming-Xia primaju tretman, dok Narumi, Rockenfield, Malina i Tor suočavaju smrtonosne zamke u ponoćnom cirkusu. Podijelili su se u dvije grupe, s Narumijom grupom navigacijom tamnog stubišta. Ostali ulaze u komoru koja zahtijeva borbu da nastave. George i Ashihana stižu helikopterom. Ispod, Narumina grupa se suočava s više zamki, a bezlični zapovjednik žrtvuje se kako bi spasio Narumi, koji se ponovo ujedi sa Tor, Timbavati, Rockenfield-om i Malinom da se suprotstavljaju pionirima.

Tor, Timbavati, Rockenfield i Malina bit bi se bitci Quatre Pionniers. Oslabljeni narumi bori se da bi došli do francine lutke. Lucille stiže sa Fatimom, Ming-Xia, Ashihana i Georgeom, otkrio je njenu francinu marionetu, Angelinu, zaustavljajući cirkus. Lucille uvjerava DotTore da napusti Francine, ali on je u fatalno rani, uzrokujući da je kristalizira. Tor samouništava za uklanjanje automata, omogućujući naručivo liječenje. Timbavati bitkama Columbine, koristeći svoju shirogane krv da je neutralizira, ali oboje umiru.

Pantalone i Arlecchino uništavaju francine marionetu i Georgea. Shiroganski doktor umire uštedu narumi. Fatima Spinetina ne uspije protiv pantalone i Arlecchinoa, ali Narumi ih pobedi. Lady Francine otkriva da je kopija, a pravi francin je drugdje. Narumi napada Shirogane, poštujući je za Francine na osnovu zahtjeva za preživjelom gostovanja, ali poštedi je nakon što se prisjeti svoju prošlost sa Masaru.

Na ruševinama Saiga, Masaru prima slovo i ključeve od Sadayoshija, otkrivajući da se on otac preporodio. Kuroga puppeteers attack with Shogetsu, believing Masaru is Sadayoshi. Masaru koristi Goyellemes i kapetan Nemo da ih pobijedi, ali zarobljavaju i dovode pred Shōjijeve svjesne ostatke.