Shinra, dječak koji živi u šumi s misterioznim ovlastima, poziva Ginko, Mushishi, da mu pomogne u svojim problemima. Dok Ginko boravi sa Shinrom, on mu kaže sve o Mushiju i njegovim ovlastima. Kasnije, dok hodate u Houseu u Shinriinoj kući, Ginko pronalazi Mushi ... Ali ovo nije obična Mushi, to je Shinra baka!

Djevojčica po imenu Sui ima neobičnu bolest koja uzrokuje bol u očima kad god vidi svjetlost. Mora biti zaključana u pitch crnoj šupi koja nema svjetlost u njemu. Dječak po imenu Biki pomaže sui uklanjanju zavoja, dajući joj hranu i samo razgovara s njom. Bikina majka brine se za njega kako bi dobio bolest, pa mu kaže da ne ostane sve dok on normalno želi sa sui. Jednog dana dok Biki razgovara s njom, ona mu govori zašto ima tu bolest: u njenim očima ima Mushi. Biki se nastavlja da se brine za nju do jedne noći kad ga čita svijeća, čudna bol dolazi na njegove oči.

Na tihim snježnim noćima, kada se ne mogu čuti zvuk, mnogi ljudi gluh u jednom ili oba ušiju. Ljekari ne mogu ništa učiniti, pa misle da bi moglo biti paranormalno. Gindo gleda u neke od seljana uši i on im kaže da je uzrok Mushi zvan "UN". Nakon što su se bavili svojim malim problemima, postoji još jedna osoba koja je izgubila zvuk u oba uka, a njegovo stanje je vrlo drugačije od ostalih ljudi, kao što je na glavi i prerasla četiri roga na glavi.

Ginko čuje glasine po gradu koji čovjek ima proročke snove svaki put. Sumnja da Mushi živi u svojim snovima. Daje čovjeku lijeko da ih drži pod kontrolom i kaže da će se vratiti kad je koristio za sve njih. Kad se Ginko vraća, selo je napušteno i rastrgano. Ginko pronalazi čovjeka sama u je kući. Čovjek mu onda govori o onome što se dogodilo dok nije bio.

Adashino-Sensei traži da kupi neke od predmeta koji je Gindo dobio na svom putovanju. Posebno želi da vinska čaša koju je nacrtala Shinra, ali Ginko kaže da je previše rijetko da se prodaje kolekcionarima. Kaže Adohenei-Senseiu o čudnom biću koji se upoznao dok je u šumi i objašnjava i kako se močvari kreće prema moru. Ovo izgleda kao rad Mushi ...

Ginko je na drugoj avanturi kao što je on doveden na vrlo osebujan otok, mladić Nagi. Gindo se uzima da vidi djevojku, koja se stanovnici ostrvima odnose kao "Ikigami" i kaže se da mogu izvesti čuda, međutim Gindo otkriva da postoji više toga.

Na kišnom danu Gindo se odmara od svojih putovanja i nailazi na muškarca po imenu Kourou koji se čini da je opsednut dugama. Da biste prošli vreme Kourou u svojoj prošlosti, sa događajima koji su doveli do njega kako bi se progonili duge kad god se pojave. Ginko mu objašnjava da duga koju traži je zapravo Mushi poznat kao "koda", ali čini se da je to više.

Gindo čeka uz morsku obalu, za prevoz da ga izvuče preko zaljeva kada upozna čovjeka koji se zove Shirou, koji je izgubio ženu pod čudnim okolnostima. Ginko mi se čini zainteresiranim i odlučuje slušati njegovu priču o tome kako je izgubio ženu u roju morskih zmija, tokom magle. Ginko se kasnije vraća s informacijama o Mushiju koji su izazvali bizarne događaje.

Dok je na putu, Ginko se spojio na grad koji je ove godine donio veliki usjev, zahvaljujući svojim precima. Međutim, kaže se da neko mora biti žrtvovan u zamjenu. Ginko smatra da se ovo osebujno i odluči istražiti da će vidjeti selo "Saisho-Sama" (glavni tužni) koji bi mogao imati neke veze s tim.

Neka djeca ulaze u šupu Adashino-Sensei i pronalaze puno čudnih stvari, ali posebno je jedna stvar koja ih zanima. Noć je i Adashino-Sensei pozvan da pogledaju jednu od djece, djevojku koja je postala gorko hladna, a uzrok je misteriozan kamen tinta koji je dodirnuo. Srećom za Adashino-Sensei, Gindo prolazi kroz selo, a on mu pokazuje kamen mastila, koji ga identificira kao "kumohami".

Ginko stiže u selu u kojem su muškarci u grijanoj diskusiji o planini. Nakon učenja Ginkovog identiteta, zatraže mu pomoć da pronađe još jedan Mushi-Shi zvan Mujika, koji se događa kao gospodar planine. Dok je na putu kroz planinu Ginko spotakne preko dječaka koji također traži Mujiku. Kasnije oni uspiju pronaći Mujiku, ali ovo nije kraj toga.

"Ne dozvolite sebi da se zaslepite strahom i ljutnjom. Sve je samo onako kako je ..." Dječak po imenu Yoki, koji je u stanju da vidi Mushi, pronađen je u šumi neke misteriozne dame po imenu Nui sa samo jednim okom. Ispada da je Yoki putovao sa majkom kada je blato srušila majku i on je ostao sama. Yokijeva noga kasnije se kasnije liječi, međutim, ne postoji ne drugdje, tako da ostane sa Nui-om i počinje naučiti neke stvari o Mushiju poznatim kao "Tokoyami".

Samo uspeva da pređem izdajnički most Kazura, Ginko se savlada sa muškarcem s druge strane koji ga vodi u susret damu nazvan Hana, koja je pala s istog mosta prije 3 godine. Iako je Hana preživela, sve što radi je sjedeći pod suncem i ništa drugo i ne čini se da niko ne zna šta nije u redu s njom. Hana se plaši da bude "Tanimodori", koji su ljudi čiji su umovi i uspomene obrisani čisti