Shinra, dječak koji živi u šumi s misterioznim ovlastima, poziva Ginko, Mushishi, da mu pomogne u svojim problemima. Dok Ginko boravi sa Shinrom, on mu kaže sve o Mushiju i njegovim ovlastima. Kasnije, dok hodate u Houseu u Shinriinoj kući, Ginko pronalazi Mushi ... Ali ovo nije obična Mushi, to je Shinra baka!

Djevojčica po imenu Sui ima neobičnu bolest koja uzrokuje bol u očima kad god vidi svjetlost. Mora biti zaključana u pitch crnoj šupi koja nema svjetlost u njemu. Dječak po imenu Biki pomaže sui uklanjanju zavoja, dajući joj hranu i samo razgovara s njom. Bikina majka brine se za njega kako bi dobio bolest, pa mu kaže da ne ostane sve dok on normalno želi sa sui. Jednog dana dok Biki razgovara s njom, ona mu govori zašto ima tu bolest: u njenim očima ima Mushi. Biki se nastavlja da se brine za nju do jedne noći kad ga čita svijeća, čudna bol dolazi na njegove oči.

Na tihim snježnim noćima, kada se ne mogu čuti zvuk, mnogi ljudi gluh u jednom ili oba ušiju. Ljekari ne mogu ništa učiniti, pa misle da bi moglo biti paranormalno. Gindo gleda u neke od seljana uši i on im kaže da je uzrok Mushi zvan "UN". Nakon što su se bavili svojim malim problemima, postoji još jedna osoba koja je izgubila zvuk u oba uka, a njegovo stanje je vrlo drugačije od ostalih ljudi, kao što je na glavi i prerasla četiri roga na glavi.

Ginko čuje glasine po gradu koji čovjek ima proročke snove svaki put. Sumnja da Mushi živi u svojim snovima. Daje čovjeku lijeko da ih drži pod kontrolom i kaže da će se vratiti kad je koristio za sve njih. Kad se Ginko vraća, selo je napušteno i rastrgano. Ginko pronalazi čovjeka sama u je kući. Čovjek mu onda govori o onome što se dogodilo dok nije bio.

Adashino-Sensei traži da kupi neke od predmeta koji je Gindo dobio na svom putovanju. Posebno želi da vinska čaša koju je nacrtala Shinra, ali Ginko kaže da je previše rijetko da se prodaje kolekcionarima. Kaže Adohenei-Senseiu o čudnom biću koji se upoznao dok je u šumi i objašnjava i kako se močvari kreće prema moru. Ovo izgleda kao rad Mushi ...

Ginko je na drugoj avanturi kao što je on doveden na vrlo osebujan otok, mladić Nagi. Gindo se uzima da vidi djevojku, koja se stanovnici ostrvima odnose kao "Ikigami" i kaže se da mogu izvesti čuda, međutim Gindo otkriva da postoji više toga.

Na kišnom danu Gindo se odmara od svojih putovanja i nailazi na muškarca po imenu Kourou koji se čini da je opsednut dugama. Da biste prošli vreme Kourou u svojoj prošlosti, sa događajima koji su doveli do njega kako bi se progonili duge kad god se pojave. Ginko mu objašnjava da duga koju traži je zapravo Mushi poznat kao "koda", ali čini se da je to više.

Gindo čeka uz morsku obalu, za prevoz da ga izvuče preko zaljeva kada upozna čovjeka koji se zove Shirou, koji je izgubio ženu pod čudnim okolnostima. Ginko mi se čini zainteresiranim i odlučuje slušati njegovu priču o tome kako je izgubio ženu u roju morskih zmija, tokom magle. Ginko se kasnije vraća s informacijama o Mushiju koji su izazvali bizarne događaje.

Dok je na putu, Ginko se spojio na grad koji je ove godine donio veliki usjev, zahvaljujući svojim precima. Međutim, kaže se da neko mora biti žrtvovan u zamjenu. Ginko smatra da se ovo osebujno i odluči istražiti da će vidjeti selo "Saisho-Sama" (glavni tužni) koji bi mogao imati neke veze s tim.

Neka djeca ulaze u šupu Adashino-Sensei i pronalaze puno čudnih stvari, ali posebno je jedna stvar koja ih zanima. Noć je i Adashino-Sensei pozvan da pogledaju jednu od djece, djevojku koja je postala gorko hladna, a uzrok je misteriozan kamen tinta koji je dodirnuo. Srećom za Adashino-Sensei, Gindo prolazi kroz selo, a on mu pokazuje kamen mastila, koji ga identificira kao "kumohami".

Ginko stiže u selu u kojem su muškarci u grijanoj diskusiji o planini. Nakon učenja Ginkovog identiteta, zatraže mu pomoć da pronađe još jedan Mushi-Shi zvan Mujika, koji se događa kao gospodar planine. Dok je na putu kroz planinu Ginko spotakne preko dječaka koji također traži Mujiku. Kasnije oni uspiju pronaći Mujiku, ali ovo nije kraj toga.

"Ne dozvolite sebi da se zaslepite strahom i ljutnjom. Sve je samo onako kako je ..." Dječak po imenu Yoki, koji je u stanju da vidi Mushi, pronađen je u šumi neke misteriozne dame po imenu Nui sa samo jednim okom. Ispada da je Yoki putovao sa majkom kada je blato srušila majku i on je ostao sama. Yokijeva noga kasnije se kasnije liječi, međutim, ne postoji ne drugdje, tako da ostane sa Nui-om i počinje naučiti neke stvari o Mushiju poznatim kao "Tokoyami".

Samo uspeva da pređem izdajnički most Kazura, Ginko se savlada sa muškarcem s druge strane koji ga vodi u susret damu nazvan Hana, koja je pala s istog mosta prije 3 godine. Iako je Hana preživela, sve što radi je sjedeći pod suncem i ništa drugo i ne čini se da niko ne zna šta nije u redu s njom. Hana se plaši da bude "Tanimodori", koji su ljudi čiji su umovi i uspomene obrisani čisti i oni umiru u noći da se pojavi "jedno noći most". Iz info okupljenih Ginko zna da Hana posjeduje Mushi nazvan "nisekazura".

Dok se odmara u bambusovoj šumi, Gindo se približava čudan čovjek po imenu Kisuke, koji kaže Ginku da je u šumi izgubljeni u šumi 3 godine. Čini se da je Ginko postao izgubljen i odluči da se spusti i shvati nešto o šumi. Nakon što se uspije izlazi iz šume, Gindo su izvukli da je to djelo "magaridake".

"Kad se svi skloni unutra, dolazi imitacija proljeća. Dugo se zadržava u blaženstvu i vaše meso će uskoro biti smrznuto ..." Uhvaćen u mećavu, Ginko se odlučuje potražiti sklonište i pronalazi dom u kojem vlasnik, Suzu omogućava da ostane noć. Sledećeg dana Ginko vidi dječaka, Miharu, koji mi se čini fasciniran od Mushi. Ginko saznaje da je Miharu jednom nestao u planinama zimi, a zatim se iznenada vratio u proljeće, u stanju da vidi Mushi. Miharu ovo ponavlja ovo od tada, a to može biti uzrokovan "Harumagari", tako na kraju, Ginko se odluči da ga nauči više o Mushiju.

Proljeće je, a Ginko vozi čamcem preko rijeke, kada čamac, Kaji, pita Gindo da li bi mogao pomoći svojoj majci, ko ne može spavati. Na prvi pogled izgleda da je progresivna amnezija, međutim nešto nije u redu.

"Postoje bezbroj pukotina u fizičkom svijetu. Oni koji nestaju poput dima izgube se u takvim udubinama. Bez njihovih sjećanja, bez njihovih duša ..." Ginko dobija pismo u kokonu, ali nije mu se nije saglasan. Umjesto toga, upućeno je starom postupku, Aya Tozawa, pa odluči da je posjeti. Ginko je zabrinut za Aya, jer još uvijek traga za njenom sestrom, koja je zarobljena u Uroani 5 godina.

Ova priča govori o misterioznom genijskom umjetniku po imenu Kai koji je napustio svoju porodicu da postane poznatiji po svojim talentima i kao razdvajanje poklona, njegova sestra ga je učinila haori (čovjekov kimono). Jednog dana mu je dosadio i napravio hauru (slikanje unutar jakne) na svom Haoriju. Njegov gospodar je ovo vidio i prepoznao svoje talente, pa je dao kai poslove sa klijentima i brzo je počeo postati dobro poznat po svom radu, ali njegova slava je došla po cijeni.

Seijirou su fascinirane zvijezde i uživaju u zvijezdi. Jednog dana bio je pored korita sa selom Nanny Fuki kad primijeti niz koji silazi niz nebo i kako pokušava povući odjednom, ona nestane, neposredno prije Seijirouevog oka. Ginko putuje kroz planine i prati ga osebujna djevojka. Ispada da je Fuki, koji je bio izložen snažnom prisustvu Mushi i niko ne može vidjeti.

Ginko stiže na osamljeno mjesto, kako bi se zadovoljio staro poznanstvo, koji se čini da je zadužen za veliku količinu arhiva, povjerljivog teksta. Gindo je dozvoljeno da ga pročita i otkriva da je to djelo Tan'yua, pisca. Tan'yu je potomak porodice Karibusa, rođen je sa crnim oznakom na dijelu njihovog tijela.

Dama po imenu Aki otkrila je zelenu mrlju na njenoj vjenčanici, godinu dana kasnije rodila je dječaka koji, sada odrastao, ima iste ocjene na njegovom tijelu. Ispada da je dječak prvobitno rođen ne kao ljudski, već kao neki oblikovan zeleni mrlje, koji se tada pretvorio u čovjeka. Njezin suprug traži od Ginkove pomoći, ali on još nije u stanju spasiti sina jer je to djelo "Watahakija".

"Rodite me još jednom. Želim vas još jednom upoznati. Želim još jednom vidjeti ovaj prekrasan ocean ..." Ginko stiže na ostrvo pitajući o takozvanom "ponovnom rođenju", ali nema sreće. Noću kasnije upoznaje osebujnu damu koja se dogodi da bi mogla vidjeti čudno svjetlo u moru i ona ga završava pozivajući na njen dom. Kasnije mu objašnjava šta su "ponovni rod"; Kad osoba uskoro umre, mogu se uzimati duboko u Ryuugu, gdje se ponovo rodi.

U hladnom planinskom regionu, Ginko luta oko ravnice snijega kada čuje zvuk zvoni kroz hladni zrak i on također primjećuje neku hrđu na drvetu. Ginko ulazi u obližnji grad kako bi pronašao prekrivanje hrđe svuda, uključujući i ljude. Šef sela govori Gindo da je to bolest koja je 14 godina utjecala na grad da ljudi polako gube pokrete udova i kaže se da je djevojka zvana Shige.

"Izgradite vatru - noć dolazi ... zapalite vatru - tama dolazi ... Sakrijte vatru - plamen je nastao sa leševa u ..." Ginko se susreće s drugim Mushi-Shijem, što se događa da je mlada dama koja se zove Yahagi i okruženje sela u kojem živi nova je raznolikost Mushi koji raste na poljima planine. Postaje tako loše da su seoski ljudi u riziku i kao krajnje sredstvo planiraju spaliti cijelu planinu, ali Ginko ne misli da je to prava opcija.

"Sve što je u mom svijetu ... čini se zvučnim ukusom i dodir. To je sve. To je dovoljno ..." Konačno može doći do grada, Ginko nailazi na "Biwa Hoshi" pod nazivom Amane, pjevajući pjesme o Mushiju i ona je odmah u stanju reći da je Mushi-shi. Tako da ga prisiljava da ostane u noći u gostionici kada ona kasnije otkriva da je jednom vidjela "ganpuku" vrlo rijetku mushi koji će domaćin vidjeti bolje i bolje dok ne umre.

Taku je osebujni mladić koji se uvijek pitao ko su ljudi to uvijek prolazili u planinama tokom kišnih sezona. Jednog dana upoznaje dječaka po imenu Isaza, dok privlači ribu. Čini se da ne samo Taku ne može vidjeti Komiyaku u planinama, međutim, čini da Isaza zna mnogo više o planini od njega. "Svijet je ispunjen životom nepoznatom čovjeku ..."